Segundo Lignon; Bottecchia (2005), na agropecuária, é recomendável que todo sistema de produção adote práticas de produção menos agressivas, que respeitem os recursos naturais e tenham por objetivo a auto-sustentação, com vistas a preservar a biodiversidade dos ecossistemas, bem como a saúde do consumidor e obter produtos de alta qualidade, fortalecendo assim as medidas  que  vêm  sendo  implantadas  em  outros  setores,   que  podem  amenizar  as  mudanças  globais  ocorridas   nas últimas  décadas. Desta forma, o manejo da criação animal tem, como princípios, o respeito ao bem-estar animal e sua qualidade de vida, sendo necessário dispor de instalações funcionais e confortáveis, com alto nível higiênico, em todo o processo criatório. A diminuição do estresse é aplicada em todos os segmentos da criação, para diminuir o risco de infecções, minimizar a contaminação do ecossistema e resguardar a saúde do consumidor do produto.

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A linha de pesquisa em Manejo Agroecológico na Sanidade Animal, do Núcleo de Estudos Agroecológicos do IFS (NEA/IFS), se pauta no bem estar animal e nos princípios agropecuários sustentáveis, priorizando o uso de recursos naturais renováveis, insumos internos e uso de tecnologias que visem à conservação ambiental e da agrobiodiversidade. 

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